1、酷捕滥捞导致长江无鱼
酷捕滥捞是淡水鱼资源大幅衰减的主要“凶手”之一，不仅削减渔业资源的“存量”，还严重破坏“增量”。长江中下游包括两湖流域，渔民使用电捕、“迷魂阵”、人工围堤、密眼网具等违法捕捞行为广泛存在。渔获物呈现数量少、质量低、幼龄化的趋势。这种竭泽而渔的方式对长江渔业资源的破坏是毁灭性的。
2、江豚、白鲟等大型珍稀动物无食
白鱀豚、江豚、白鲟等大型珍稀保护动物都是以鱼为食的。除了非法捕捞手段和轮船螺旋桨对它们造成伤害外，导致这几种动物消失或数量锐减的重要原因，就是鱼类数量锐减。长江“无鱼”，最直接伤害的就是这些处于食物链金字塔顶端的大型动物。作为长江的旗舰物种，白鱀豚已被宣布功能性灭绝，白鲟已宣布灭绝；江豚仅剩千余头，若再不采取措施，或在15年后消失。旗舰物种不在，长江生态系统危矣。
3、天然种质资源库最后保种
目前，四大家鱼占我国淡水渔业养殖产量约50%，然而其种质资源质量整体在下降。根据我国“三江”(长江、珠江、黑龙江)“四大家鱼”种质调查结果，长江水系的种质无论是表型还是遗传多样性等方面都是最好的。因此，通过全面禁渔保住长江这个天然种质资源库，恢复长江野生鱼类的自然生态系统，关系到淡水养殖业的发展和未来。
4、现行的禁渔期制度存在天然缺陷
每年3-4个月的禁渔期制度对渔业资源保护起到了一定的效果，然而，由于酷捕滥捞的屡禁不绝，自然繁衍的后代还来不及长大就在3个月解禁后被捕捞。此外，目前开展的人工增殖放流活动，往往形式大于内容。放流的鱼苗不久就可能被捕捞出现在市场上，实际效果大打折扣。而且，增殖放流还存在着影响或改变鱼类种群遗传结构的风险。
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