蓄水池里的青苔可以抽干水，人工清理掉，这是目前最为有效和最为直接的方法。或者养食苔性鱼类和小虾，对除苔有一定效果。亦或者是可从水族商店购买除苔剂进行化学杀灭。
青苔大量繁殖的危害
1、严重消耗水体中的无机盐类，使虾、蟹池中正常的营养物质代谢遭到破坏，水质变得清瘦。严重影响虾、蟹类的生长。
2、由于青苔大量生长，导致池水太清，阳光直射池底，虾、蟹等由于受到太强阳光的照射而产生应激反应，时间一长，导致大面积发病。
3、当青苔在虾、蟹池大量繁殖时，会遍布全池，缩小了养殖水体空间。
青苔衰老时丝状体往往断离池底，浮于水面上，起水后的虾、蟹一旦蹦到青苔上面或爬到里面，由于青苔如棉絮状，虾、蟹无法挣扎出来直至死亡，从而使虾、蟹的养殖成活率降低。青苔大量繁殖，盖住池底，养殖的虾、蟹等有时也会窒息而死。
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